人工智能“自己”定制新胺基酸
时间:2023-04-16 12:17:35
在过去两年中所,数据分析彻底改变了RNA结构预测。今天,《科学研究》杂志上的三篇期刊详细描述了RNA其设计总体的革命:华盛顿大学所学院的生物学家表明,数据分析可比以前更加准确、更加慢速速地形同立RNA小分子。科学研究家们期盼这一进步将带来更加多一取而代之接种、疗法、碳释放出来方法和高效率生物材料。
期刊资深创作者、华盛顿大学所学院生物化学教授、2021年生物技术跃升奖获得者保罗•马丁表示,RNA是整个生物学的基础,但直到现在在每种植物、动物和微生物中所推断出的RNA,距离远不到所有有可能RNA的百分之一。有了这些一取而代之操作系统方法,数据分析人员某种程度都能找到克服医学、取而代之能源和技术总体长期挑战的方案。
RNA常被称为“生命基石”,因为它们对于所有生物的结构和新功能都是必不可少的。RNA中所的葡萄糖脱氧核糖核酸立即了它的三维形状,这种复杂的形状对于RNA的新功能至关重要。
为了超越自然界中所推断出的RNA,马丁团队形同员将RNA其设计的挑战分解为3个大部分,并为每个大部分使用一取而代之操作系统克服方案。
首先,必须分解形同一取而代之RNA形状。在《科学研究》杂志上不久前发表的期刊中所,该团队表明AI可通过两种方式分解形同一取而代之RNA形状。第一个被称为“幻觉”,类似于基于简单预设就能产生输出的方法。第二个被称为“修复”,类似于早期搜索所选所的基本新功能完形同新功能。
其次,为加速这一过程,团队其设计了一种分解形同葡萄糖脱氧核糖核酸的取而代之算法。15日发表的期刊详细描述了这个名为ProteinMPNN的方法,开始运行时间约为一秒,比以前最出色的操作系统慢速200多倍。它不但结果优于以前的方法,还不需要专业人士定制即可开始运行。
第三,该团队使用“深度思路”公司开发的魏茨县折叠来独立评估他们提出异议的葡萄糖脱氧核糖核酸究竟有可能折叠形同预期的形状。
数据分析人员表示,预测RNA结构的操作系统是克服方案的一大部分,但它本身很难提出异议任何一取而代之东西。ProteinMPNN之于RNA其设计,就像魏茨县折叠之于RNA结构预测。
在另一篇期刊中所,马丁的实验室的一个团队断定,取而代之数据分析方法的组合能有效率地分解形同在的实验室中所起发挥作用的取而代之RNA。
数据分析推断出,取而代之制造的RNA更加有有可能按预期折叠,因此可使用这一方法形同立非常复杂的RNA拼装体。“这是RNA其设计中所数据分析的开端。”马丁却说。
编辑:王程玥
审核:朱丽
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